越橘反转录转座子插入多态性分子标记开发及品种鉴别

编号 zgly0001576137

文献类型 期刊论文

文献题名 越橘反转录转座子插入多态性分子标记开发及品种鉴别

作者 吴志娟  方茜  李永强  陈文荣  宗宇  郭卫东 

作者单位 浙江师范大学化学与生命科学学院浙江省特色经济植物生物技术研究重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S663.9 

关键词 越橘  反转录转座子  分子标记  亲缘关系  品种鉴别 

文摘内容 从蔓越橘(Vaccinium macrocarpon Ait.)品种‘Ben Lear’基因组序列中发掘了398 014 bp的长末端重复序列反转录转座子(LTR-RT),占整个基因组序列的11.17%;鉴别出228条Ty1-Copia家族成员和137条Ty3-Gypsy家族成员。以45个越橘(Vaccinium spp.)品种和1个蔓越橘品种为材料,从53对基于LTR-RT插入位点开发的引物中筛选出17对多态性引物,建立了越橘品种的LTR-RT插入多态性(RBIP)分子标记。使用RBIP标记对46个品种进行了亲缘关系分析和分子身份证构建,其中多态性最高的位点是Vmrg1,最低的位点是Vmrg14。其PCR产物的大小变化范围为200~463 bp,最小长度片段和最大长度片段分别出现在位点Vmrc19和Vmrc3。46个品种基于遗传距离聚为6组,组Ⅰ包括3个北高丛越橘品种,蔓越橘单独聚为组Ⅵ,其他4组中北高丛越橘、南高丛越橘或兔眼越橘混杂在一起。利用17个位点组成的1、0字符串构建了45份越橘品种和1份蔓越橘品种的唯一分子身份证,为越橘品种的鉴别提供了参考。