一种来自长柄扁桃、桃和梅的包含AP2结构域基因的生物信息学分析

编号 zgly0001566449

文献类型 期刊论文

文献题名 一种来自长柄扁桃、桃和梅的包含AP2结构域基因的生物信息学分析

作者 赵欢蕊  段义忠  相微微  王建武 

作者单位 榆林学院生命科学学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年08期

年份 2017 

分类号 Q943.2 

关键词 长柄扁桃  AP2  转录组  低拷贝核基因 

文摘内容 通过分析长柄扁桃幼苗叶片转录组测序,从中找到一个包含AP2结构域的Unigene,该Unigene包含完整的开放读码框,全长3182bp,编码767个氨基酸,将其命名为ApAP2dc1。以ApAP2dc1的DNA序列作为信息探针,在桃和梅的基因组序列中进行查询比较,发现桃和梅的基因组中均存在ApAP2dc1的直系同源基因,分别命名为PpAP2dc1和PmAP2dc1。在桃和梅的基因组中还各发现一个串联重复的旁系同源基因,分别命名为PpRYdc1和PmRINGdc1。保守结构域分析表明,ApAP2dc1、PpAP2dc1和PmAP2dc1都含有AP2结构域,而PpRYdc1和PmRINGdc1不含AP2结构域;基因结构分析表明,PpAP2dc1和PmAP2dc1、PpRYdc1和PmRINGdc1虽然互为直系同源基因,但其基因结构有明显差异;旁系同源基因的启动子序列也有较大差异。该研究结果表明长柄扁桃、桃和梅基因组上的上述区域在进化上不保守,该区域的基因在结构和表达上正在进行快速趋异进化。