黑腹果蝇热激蛋白基因家族的生物信息学分析

编号 zgly0000701401

文献类型 期刊论文

文献题名 黑腹果蝇热激蛋白基因家族的生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 牟国鹏  陈斌  何正波 

作者单位 重庆师范大学生命科学学院昆虫与分子生物学研究所活性物质生物技术教育部工程研究中心重庆市动物生物学重点实验室 

母体文献 重庆师范大学学报: 自然科学版 

年卷期 2011,28(3)

页码 10-17,F0003

年份 2011 

分类号 Q811.4 Q963 

关键词 黑腹果蝇  热激蛋白  生物信息学  系统发育 

文摘内容 热激蛋白是细胞或生物体受到热激后新合成的一类遗传上高度保守的蛋白, 在生物体中普遍存在, 在细胞生长、发育、分化、基因转录等功能方面发挥重要的作用。本研究利用生物信息学方法首次对黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)全部热激蛋白进行分析。结果表明, 黑腹果蝇热激蛋白共有HSPC(HSP90)、HSPA(HSP70)、DNAJ(HSP40)、HSPB(小分子HSP)、HSPD(HSP60)、CCT(TRiC)等6个基因家族, 不存在HSPE(HSP10)和HSPH(HSP110)家族, 共有35个基因, 新发现7个基因, 命名为HSPBA5、HSPBB2、HSPBB3、DNAJA7、DNAJA8、HSPD5和HSPCB1。染色体定位表明, 黑腹果蝇热激蛋白主要分布在2L、3L、2R、3RP和X上。序列比对分析发现, 黑腹果蝇热激蛋白家族序列高度保守。进化分析表明, 他们有共同的祖先, 可分为6个基因家族。