应用iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术分析草菇同核和异核菌丝蛋白质组

编号 zgly0001419889

文献类型 期刊论文

文献题名 应用iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术分析草菇同核和异核菌丝蛋白质组

作者 刘靖宇  江玉姬  谢宝贵  陈炳智  廖伟  邓优锦  刘朋虎 

作者单位 福建农林大学菌物研究中心  山西农业大学食品科学与工程技术学院 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2012年01期

年份 2012 

分类号 S646.13 

关键词 草菇  蛋白质组  iTRAQ  二维液相色谱  串联质谱 

文摘内容 首次利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术结合二维液相色谱串联质谱对草菇(Volvariella volvacea)同核和异核菌丝蛋白质组进行研究。采用QExactive质谱鉴定并经MASCOT软件搜库,对所有鉴定蛋白进行主成分分析(principal component analysis,PCA)、层次聚类(hierarchical clustering)分析和GO(gene ontology)注释,并进行生物信息学分析。结果共获得2335个不同肽段,鉴定到1039个蛋白,其中1030个蛋白具有定量信息。在同核菌丝中显著上调蛋白83个,下调蛋白97个,表明iTRAQ标记技术结合二维液相色谱串联质谱可有效地分离和鉴定草菇菌丝蛋白质组。该研究结果为更深入全面地研究草菇菌丝蛋白质组学奠定基础。