油茶种子EST文库构建及主要表达基因的分析

编号 zgly0000393277

文献类型 期刊论文

文献题名 油茶种子EST文库构建及主要表达基因的分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 谭晓风  胡芳名  谢禄山  石明旺  张党权  乌云塔娜 

作者单位 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室  中南林业科技大学资源与环境学院 

母体文献 林业科学 

年卷期 2006,42(1)

页码 43-48

年份 2006 

分类号 S718.46  Q943.2 

关键词 油茶  cDNA  EST  文库  表达基因 

文摘内容 为研究油茶种子在油脂转化高峰期的基因表达并分离克隆与油脂合成等有关的重要基因, 以油茶优良无性系湘林1号和湘林4号近成熟种子为材料构建cDNA文库; 随机挑取2327个克隆进行3’端测序构建EST文库。将数据完整并无X、N的1979条eDNA序列与NCBI核酸数据库的非冗余序列进行同源性比较, 确认763条cDNA序列与核酸数据库中其他物种的DNA序列具有很高或较高的同源性, 可确认266种基因; 有1216个克隆序列为未知功能的基因序列。各类基因表现出不同的表达丰度, 其中贮藏蛋白基因、与基因表达调控相关的基因、抗逆相关基因、种子成熟和胚胎发育相关的基因等为高丰度表达, 与脂肪酸代谢相关的基因等为中丰度表达, 另外还有大量的其他基因和未知功能基因在种子中表达。各类基因表达的数量和趋势与种子接近发育成熟阶段相吻合。