长白落叶松群体4CL基因单核苷酸多态性分析

编号 zgly0001461441

文献类型 期刊论文

文献题名 长白落叶松群体4CL基因单核苷酸多态性分析

作者 徐悦丽  张含国  施天元  姚宇  张磊  王艳红  刘灵 

作者单位 东北林业大学 

母体文献 植物研究 

年卷期 2013年02期

年份 2013 

分类号 S791.22 

关键词 长白落叶松  家系  单核甘酸多态性  4CL基因 

文摘内容 以黑龙江省林口县青山林场21年生长白落叶松(Larix olgensis Henry)异地保存种为材料,利用SNP标记方法和DNAMAN软件分析白刀山种源子代林的单核甘酸多态性情况。从分子水平证明长白落叶松具有丰富的遗传多样性,用4CL-A引物检测到178个SNP多态位点。共测序240条EST序列,测序成功193条,测序成功率为80.42%。本研究178个SNP变异中,有126个属于转换类型,占总变异的70.79%;有52个属于颠换类型,占总变异的29.21%,变异类型符合,转换∶颠换=7∶3。在转换类型中,A/G和C/T转换分别占37.08%和33.71%;颠换类型中G/C、A/C、A/T、和G/T分别在占7.87%、8.99%、7.87%和4.99%。但每个家系内的转换和颠换的比例相差较大,没有规律。转换和颠换的比例最大的是554号家系,其比值为7∶1,最小的家系是855号家系,其比值为3∶4。