基于月季微卫星标记的7个遗传相似系数比较

编号 zgly0000817650

文献类型 期刊论文

文献题名 基于月季微卫星标记的7个遗传相似系数比较

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 黄平  崔娇鹏  郑勇奇  张川红 

作者单位 国家林业局植物新品种分子测定实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所 

母体文献 林业科学 

年卷期 2013(1)

页码 68-76

年份 2013 

分类号 S718.46 

关键词 月季  品种  多倍体  微卫星标记  遗传相似系数  聚类分析 

文摘内容 以月季品种的微卫星标记数据为基础,选择7个遗传相似系数对月季品种间遗传相似度进行计算,并采用非加权组平均法(UPGMA)建立相应的系统树。通过遗传相似系数相关性、聚类结果一致性以及拟合优度等分析方法,探讨不同的遗传相似系数在微卫星遗传分析中的适用性。分析数据显示7个系数之间相关系数介于0.726～1.000。共表型相关系数rc介于0.85～0.93,表明品种间遗传差异在基于UPGMA方法的聚类树状图中有良好体现。系统树之间的CIc指数范围为0.468～1.000,表明采用不同相似系数进行聚类分析时,结果存在较大差异。7个遗传相似系数的S统计值介于16.24%～29.90%,RusselandRao系数最低,SimpleMatching等3个系数S值均大于20%。综合考虑分子标记特点、物种杂合度、Kruskal拟合优度等因素,并结合聚类分析与品种谱系比较结果,研究认为Dice系数和Jaccard系数适用于月季的微卫星遗传分析,其次是SimpleMatching系数。