滇东南水牛mtDNA控制区遗传多样性及其系统地位分析

编号 zgly0001411767

文献类型 期刊论文

文献题名 滇东南水牛mtDNA控制区遗传多样性及其系统地位分析

作者 亐开兴  和占星  苗永旺  李红伟  金显栋  张继才  杨国荣  黄必志  昝林森 

作者单位 西北农林科技大学动物科技学院  云南省草地动物科学研究院  云南农业大学动物科技学院  蒙自市畜牧技术推广站  国家肉牛改良中心 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2011年09期

年份 2011 

分类号 S823.83 

关键词 滇东南水牛  mtDNA D-loop  遗传多样性  系统地位  沼泽型水牛 

文摘内容 【目的】深入了解滇东南水牛(Bubalus bubalis)的遗传多样性及其在水牛中的系统地位。【方法】以29头滇东南水牛血样为材料,通过PCR扩增直接测序,测定了29条滇东南水牛个体的线粒体DNA D-loop(mtDNAD-loop)全序列,并引用GenBank公布的埃及、印度、地中海、巴西及中国水牛mtDNA D-loop序列,构建各单倍型间的聚类树。【结果】滇东南水牛mtDNA D-loop全序列长度为910～917bp,结合GenBank中公布的5条来自云南省马关县的滇东南水牛序列,界定滇东南水牛mtDNA D-loop有单倍型20种,单倍型多态度、核苷酸多态度和核苷酸差异数分别为0.877±0.053,0.011±0.005和9.865±21.419,错配分布分析表明,滇东南水牛保持着较为平稳的群体水平,揭示滇东南水牛现生群体的遗传多样性较为丰富。聚类结果显示,滇东南水牛所有个体都聚在沼泽型水牛支系,与印度、埃及、地中海等江河型水牛支系截然分列于2大独立的支系;滇东南水牛又分为支系A(SW-A)和支系B(SW-B),与其他中国水牛品种的表现一致。【结论】滇东南水牛群体规模平稳,且群体未曾受到印度水牛基因的渐渗,完全属于沼泽型水牛,支持滇东南水牛起源于中国或东南亚的假说。