菠萝MADS-box基因AcMADS2的克隆与表达分析

编号 zgly0001531006

文献类型 期刊论文

文献题名 菠萝MADS-box基因AcMADS2的克隆与表达分析

作者 杨祥燕  蔡元保  张治礼  孙光明  孙伟生  吴青松  王运儒 

作者单位 广西壮族自治区亚热带作物研究所  海南省农业科学院  中国热带农业科学院南亚热带作物研究所 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2016年09期

年份 2016 

分类号 Q943.2  S668.3 

关键词 菠萝  MADS-box基因  克隆  基因表达 

文摘内容 采用RT-PCR和RACE方法从菠萝克隆获得一个MADS-box基因,命名为Ac MADS2,Gen Bank登录号为KC257409。AcMADS2基因c DNA全长945 bp,ORF为687 bp,编码一个含有228个氨基酸的蛋白。序列分析和系统进化分析表明,AcMADS2具有保守的MADS-box结构域和半保守的K区,与其他植物中的AGL12亚家族MADS-box蛋白具有很高的同源性。生物信息学分析结果表明,Ac MADS2是不稳定的亲水蛋白,不具有跨膜结构和信号肽。α-螺旋、折叠延伸链及无规则卷曲构成了二级结构的主要蛋白框架。在三级结构中MADS-box结构域构成了该蛋白核心结构,并且作为转录因子可能定位于细胞核。实时荧光定量PCR分析表明,Ac MADS2基因在花期根中的表达量明显高于同一时期的小花、茎和叶;干旱和低温胁迫处理后,Ac MADS2基因在苗期根中的表达也明显增强。因此,推测Ac MADS2基因可能参与菠萝根发育的调控以及逆境胁迫反应。