454焦磷酸测序分析几种哺乳动物粪便细菌多样性

编号 zgly0000979490

文献类型 期刊论文

文献题名 454焦磷酸测序分析几种哺乳动物粪便细菌多样性

作者 陈秀  张晓君  李沁元  薛正晟  李桂鼎  贾鳗  赵立平  姜怡 

作者单位 云南大学云南省微生物研究所  东北大学生命科学与健康学院  上海交通大学生命科学技术学院生物科学与技术系 

母体文献 微生物学报 

年卷期 2015(6)

页码 683-690

年份 2015 

关键词 哺乳动物  糞便细菌  454高通量测序  16S rDNA  多样性 

文摘内容 【目的】分析比较几种哺乳动物粪便细菌群落多样性,了解粪便细菌多样性与动物进化和食物的关系。【方法】采集6种哺乳动物粪便样品;提取总DNA;PCR扩增,获得16S rDNA V3标签片段;用454焦磷酸测序技术进行高通量测序;主要基于QIIME平台分析比较粪便细菌多样性。【结果】分析发现,厚壁菌门和拟杆菌门广泛存在于各样品中,并且占绝对优势。α多样性分析发现,杂食性的长臂猿、黑猩猩和川金丝猴的多样性最高,其次是肉食性的东北虎,来自熊科杂食性的亚洲黑熊和大熊猫的多样性最低。