基于16S rDNA基因序列的泽兰实蝇幼虫肠道细菌多样性分析

编号 zgly0001515585

文献类型 期刊论文

文献题名 基于16S rDNA基因序列的泽兰实蝇幼虫肠道细菌多样性分析

作者 张某  杨璞  朱家颖  袁远  桂富荣  高熹  吴国星 

作者单位 云南农业大学植物保护学院  中国林业科学研究院资源昆虫研究所国家林业局资源昆虫培育与利用重点实验室  西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2016年02期

年份 2016 

分类号 S451  S476 

关键词 泽兰实蝇  肠道细菌  多样性  16S rDNA  Illumina 

文摘内容 【目的】探究泽兰实蝇Procecidochares utilis幼虫肠道细菌的多样性。【方法】利用Illumina HiSeq技术对泽兰实蝇幼虫肠道细菌的16S rDNA-V6变异区序列进行测序,应用USEARCH和QIIME等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)数量,分析物种的丰度和Alpha多样性。【结果】共获得1 593 506对reads,拼接为1 579 372条tags,经过滤后得到的1 572 860条tags聚类为1 341个OTU。总共注释到13个门,4个纲,6个目,7个科,10个属和4个种。其中变形菌门(Proteobacteria)的细菌为优势菌,占99%;在属分类阶元上,沃尔巴克氏体属Wolbachia占45%,是优势属。【结论】泽兰实蝇幼虫肠道细菌多样性丰富。相关的种类和丰度信息为后期研究揭示肠道细菌介导泽兰实蝇寄主植物专化性奠定了基础。