基于RNA-Seq技术的蜡蚧轮枝菌转录组分析（英文）

编号 zgly0001553483

文献类型 期刊论文

文献题名 基于RNA-Seq技术的蜡蚧轮枝菌转录组分析（英文）

作者 张某  高熹  郝凯强  谭清  庞仁乙  兰明先  李召波  夏涛  鲁武锋  李建一  吴国星 

作者单位 云南农业大学植物保护学院 

母体文献 生物安全学报 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 S476.12 

关键词 蜡蚧轮枝菌  RNA-Seq  转录组 

文摘内容 【目的】蜡蚧轮枝菌是一种防治植物病原物和害虫的生防菌,弄清其致病的分子基础具有重要的意义。【方法】利用Illumina HiS eq技术测序蜡蚧轮枝菌的cD NA文库,并进行RNA-Seq序列拼接和功能注释。【结果】共获得1634670条高品质reads,碱基GC含量48.50%。14856条Unigene经组装拼接后,在Nr、Swiss-Prot、COG和KEGG数据库中分别比对得到1467、9379、6518和4188条Unigenes。采用GO分类工具将21403条Unigenes分成24个功能组,主要包含在细胞组成(1369)、分子功能(1679)和生物学过程(1928)3个大类里,在COG数据库注释的基础上,把6518条Unigenes分成38个功能组,通过GO和COG丰度识别分类,聚类的主要是一般功能预测、次生代谢产物的合成、运输和分解代谢以及信号转导机制起作用的独立基因。能与KEGG路径匹配的108条Unigenes中大部分和新陈代谢途径及次生代谢产物的合成有关。【结论】这些结果将有助于找寻蜡蚧轮枝菌的致病因子,从而丰富其致病机理。