桑萜类生物合成酶HMGR的生物信息学分析

编号 zgly0000576362

文献类型 期刊论文

文献题名 桑萜类生物合成酶HMGR的生物信息学分析

作者 雷桅  汤绍虎  周启贵  税晓容  孙一铭  孙敏 

作者单位 西南大学生命科学学院三峡库区生态环境教育部重点实验室  中国科学院华南植物园 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2008,34(3)

页码 393-399

年份 2008 

分类号 S888.2  Q946.5 

关键词 桑  3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶  生物信息学  萜类化合物 

文摘内容 萜类化合物是桑叶具有药用功效的主要化学成分之一。利用Vector NTI Suit8等工具，对GenBank中的桑萜类生物合成关键酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因的核苷酸和氨基酸序列进行了生物信息学分析。桑九mgr基因序列以基因组DNA形式登录，其中1-5905bp区间为该基因序列，包括启动子、CDS和内含子序列，推测其编码蛋白的分子式为C2602H4181N715O786S29，亚细胞定位于线粒体，存在跨膜结构域，且含有22个氨基酸的质体转运肽，是含有HMG—CoA—reductase—class Ⅰ重要功能域的疏水性蛋白，二级结构以无规则卷曲和仅一螺旋为主，三级结构中含有2个HMG—CoA和2个NADP(H)结合位点。