落叶松体胚发育中12个针叶树特异microRNAs表达分析

编号 zgly0000803576

文献类型 期刊论文

文献题名 落叶松体胚发育中12个针叶树特异microRNAs表达分析

学科分类 220.1070;森林植物学

作者 张俊红  吴涛  韩素英  齐力旺  张守攻 

作者单位 中国林业科学研究院林业研究所 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2012(4)

页码 411-418

年份 2012 

分类号 S791.22 

关键词 日本落叶松  体细胞胚胎  microRNA  针叶树  表达分析 

文摘内容 以落叶松体细胞胚胎发育8个阶段的材料构建小RNA文库,进行了Solexa测序、miRNA鉴定、靶基因预测、qRT-PCR定量分析等研究。结果表明: 发现的87个miRNAs中,29个为针叶树特异的,来自12个家族,分别为miR946、miR947、miR950、miR951、miR1311、miR1312、miR1313、miR1314、miR1316、miR3701、miR3702和miR3704,其中25个长度为22nt,且在小RNA文库中的最低拷贝数为18(miR1311),最高拷贝数为33 009(miR950)。发现12个miRNA家族的34个靶基因可能参与生长发育、抗病、AGO反馈调节等多方面遗传调控;qRT-PCR分析表明: 72%miRNAs表达次高峰在后期单胚或早期子叶胚,在中期子叶胚最低,最高峰在后期子叶胚,分别与子叶形成、胚胎后熟、胚胎休眠的生理活动相吻合,而miRNA前体的表达模式不同于miRNA,前体变化幅度小于成熟体。