12个辣椒microRNA的靶标预测及表达分析

编号 zgly0001639778

文献类型 期刊论文

文献题名 12个辣椒microRNA的靶标预测及表达分析

作者 孟纯阳  魏小春  赵艳艳  原玉香  杨双娟  王志勇  张晓伟  郑直  姚秋菊  张强 

作者单位 河南省农业科学院园艺研究所  郑州大学生命科学学院生物工程系 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年12期

年份 2018 

分类号 S641.3 

关键词 辣椒  microRNA  靶标  胁迫  表达分析 

文摘内容 为了探索12个辣椒microRNA的时空表达及胁迫响应。根据辣椒中已鉴定和注释的microRNA信息,进行靶标预测和时空表达分析。靶标除转录因子外,还有ABC transporter、WD40和锌指结构等。辣椒中miRNA表达具有组织特异性,并且miRNA在果实发育中也起作用。同时,对辣椒进行脱落酸、茉莉酸甲酯、高温、低温、盐和辣椒疫病病原菌处理。采用实时荧光定量PCR检测12个miRNA在不同处理下的表达情况。结果发现micro RNA对胁迫有响应,对胁迫呈现出显著性表达差异,miR4414b受疫病胁迫上调表达,miR167在脱落酸胁迫下下调表达,miR396d经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病诱导后,显著上调表达。miR156在高温和低温胁迫下下调,靶标转录因子SBP可能上调,适应胁迫反应。但miR156a经NaCl诱导后显著上调表达,可能导致靶标下调表达。miR171c经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病处理显著下调,靶标GRAS基因可能上调抵抗胁迫,本研究对辣椒中miRNA的进一步研究提供帮助。