菜豆SBP-box基因家族的分子特征与进化分析

编号 zgly0001644871

文献类型 期刊论文

文献题名 菜豆SBP-box基因家族的分子特征与进化分析

作者 胡利宗  王俊生  刘红占  赵锦慧  王秋霞  纪秀娥 

作者单位 周口师范学院生命科学与农学学院  周口师范学院河南省作物分子育种与生物反应器重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年14期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S643.1 

关键词 菜豆  基因家族  SBP基因  转录因子 

文摘内容 SBP蛋白是植物特有转录因子,参与众多生物学过程。尽管在许多植物中SBP家族基因已经被鉴定,但在菜豆中仍然未见报道。本研究为探索菜豆SBP-box基因家族,基于生物信息学手段充分挖掘菜豆基因组和转录组数据资源,鉴定出23个菜豆SBP基因,并系统分析了这些SBP基因的结构、定位、保守基序、表达和系统进化关系。结果表明:23个基因被分为2个大类群,散落分布在10条染色体上;菜豆、拟南芥和水稻SBP蛋白共存在16种类型保守基序组成类型;菜豆SBP基因结构种类有5种,其外显子数目分别为2、3、4、9和10个;基于RNA-seq测序数据的表达分析表明菜豆SBP基因表达具有高度多样化特征,这说明参与许多生物学过程。本研究为菜豆SBP基因功能研究提供重要线索。