ERIC—PCR分子杂交技术分析大熊猫肠道菌群结构

编号 zgly0000363096

文献类型 期刊论文

文献题名 ERIC—PCR分子杂交技术分析大熊猫肠道菌群结构

作者 鲁海峰  魏桂芳  李仲逵  李红  王爱善  顾建萍  金会宇  孙强  赵立平 

作者单位 上海交通大学生命科学技术学院微生物分子生态学与生态基因组学实验室 

母体文献 中国微生态学杂志 

年卷期 2005,17(2)

页码 81-84

年份 2005 

分类号 Q959.838  S792.14 

关键词 大熊猫  群结构  Southern杂交  技术分析  分子杂交  肠道菌  ERIC-PCR  微生物群落结构  DNA提取方法  肠道微生物区系  指纹图谱  DNA样品  群落结构特征  野生动物园  相似性指数  生态学技术  区系结构  健康状况  总DNA  结构比较  不同时期 

文摘内容 目的了解大熊猫肠道微生物区系结构的相似性和稳定性, 并找出大熊猫肠道微生物群落结构的变化与健康状况的关系。方法对上海动物园及上海野生动物园所饲养的3只大熊猫2次采集的粪便样品进行微生物群落总DNA的抽提, 并以此为模板获得反映肠道微生物群落结构特征的ERIC—PCR和Southern杂交指纹图谱, 比较各DNA样品指纹图谱的相似性指数。结果除国庆(大熊猫)的第1次采集的样品(当时处于腹泻状态), 其他各DNA样品的ERIC-PCR及Southern杂交指纹图谱的相似性都达到85%～100%; 佳斯及川川(大熊猫)2个个体2次采集的样品之间ERIC指纹图谱的相似性分别为93%和87%, 而国庆腹泻时的样品与健康时的样品之间则为71%。结论大熊猫不同个体之间肠道微生物群落结构比较相似, 而且同一个体在不同时期表现出比较高的稳定性, 但当个体的健康出现问题时肠道优势菌菌群结构有一定波动。所采用的DNA提取方法、ERIC—PCR和Southern杂交指纹图谱的高度重复性证明了之一分子生态学技术在大熊猫肠道微生物区系动态监测中的可行性。