植原体tuf基因与其上游部分基因结构和相关基因启动子保守区域特征及活性分析

编号 zgly0001645586

文献类型 期刊论文

文献题名 植原体tuf基因与其上游部分基因结构和相关基因启动子保守区域特征及活性分析

作者 于少帅  林彩丽  王圣洁  张文鑫  田国忠 

作者单位 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室 

母体文献 生物多样性 

年卷期 2018年07期

年份 2018 

分类号 S432.42 

关键词 植原体  启动子  基因结构  遗传多样性  多位点序列分析 

文摘内容 植原体寄主种类多,危害范围广,开展其遗传多样性、关键基因调控等方面研究有助于提高该病害综合防治水平。通过长片段PCR引物扩增我国PaWB-sdyz、PaWB-fjfz和LY-fjya1植原体株系tuf基因及其上游6个基因的片段,进行植原体基因启动子保守区域序列特征和多位点序列分析。利用启动子探针载体p SUPV4检测植原体tuf基因上游序列的启动子活性。扩增获得PaWB-sdyz、PaWB-fjfz、LY-fjya1株系tuf基因上游12,745–12,748 bp序列,比较分析发现Pa WB-sdyz、Pa WB-fjfz、LY-fjya1、OY-M、AYWB、PAa、SLY、AT植原体株系tuf与其上游6个基因的结构顺序皆为5’-rpl L-rpo B-rpo C-rps12-rps7-fus A-tuf-3’。推测出可能的植原体启动子保守区域模式序列:T90T100G92T75G67A85（-35区）;T90A96T92A98T73T90（-10区）。基于8个植原体株系的rpl L-tuf核苷酸序列编码基因、非编码序列、氨基酸序列的多位点序列分析可将不同植原体株系以较高的支持率清晰地区分,不同植原体株系rpl L-tuf核苷酸非编码区变异水平更高。16SrI组植原体tuf基因上游序列存在3种变异类型,其代表株系PaWB-fjfz、LY-fjya1tuf基因上游130 bp片段和CWB-hnsy1 tuf基因上游129 bp片段皆具有启动子活性。