桑树桑黄菌丝体和子实体基因差异表达分析

编号 zgly0001721125

文献类型 期刊论文

文献题名 桑树桑黄菌丝体和子实体基因差异表达分析

作者 王伟科  宋吉玲  闫静  陆娜  袁卫东  周祖法 

作者单位 杭州市农业科学研究院 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2020年10期

年份 2020 

分类号 S567.3 

关键词 桑黄  菌丝体  子实体  差异表达基因 

文摘内容 通过对桑树桑黄Sanghuangporus sanghuang菌丝体和子实体2个不同生长阶段的转录组进行分析,为研究桑黄子实体生长发育相关机制奠定基础。采用Illumina测序技术,对桑树桑黄菌株S23菌丝体和子实体2个不同生长发育阶段进行了全转录组测序。将转录组测序reads比对到参考序列上,菌丝体测序样本的reads比对率为82.89%;子实体测序样本的reads比对率为83%。基因差异表达分析显示,与菌丝体相比,子实体中显著上调表达基因为2 898个,显著下调表达基因为1 965个。经过Blast nr比对发现,桑黄菌在子实体阶段表达量上升的基因主要与各种氧化酶活性、疏水蛋白等相关;表达量下降的基因主要与糖类、氨基酸结合、运输等相关。基因本体(gene ontology,GO)富集分析表明,菌丝体及子实体两个阶段与跨膜转运相关的差异表达基因富集明显。代谢通路(pathway)富集分析表明,类固醇生物合成、精氨酸生物合成、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路等差异基因富集明显。