基于SSR标记构建平菇栽培品种核心样本方法的探讨

编号 zgly0001420020

文献类型 期刊论文

文献题名 基于SSR标记构建平菇栽培品种核心样本方法的探讨

作者 李慧  陈强  黄晨阳  谢宝贵  张金霞 

作者单位 福建农林大学菌物研究中心  中国农业科学院农业资源与农业区划研究所  农业部农业微生物资源收集与保藏重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2012年10期

年份 2012 

分类号 S646.14 

关键词 平菇  核心样本  取样方法  分子标记  表型  遗传多样性 

文摘内容 为了探讨基于DNA分子标记构建平菇栽培品种核心样本的方法,基于48个平菇栽培菌株的11个SSR位点,根据遗传距离进行UPGMA聚类,采用位点优先取样策略,结合表型性状,在不同SSR等位基因保留比例(100%、95%、90%、85%、80%)水平上构建核心样本,进而确定取样量。采用稀有等位基因保留比例以及对Nei’s基因多样度和Shannon’s信息指数进行t检验,评价核心样本的代表性,并且根据表型保留比例以及极差、均值和标准差的符合率对核心样本的代表性作进一步确认。结果表明:采用位点优先取样策略,在等位基因保留比例为95%的水平上构建的核心样本能够以最小的样本量最大限度地代表原种质的遗传多样性。