丹参海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SmTPS)的克隆及其表达分析

编号 zgly0000859417

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SmTPS)的克隆及其表达分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 岳思思  姚伟  王东浩  陈玉芹  王喆之 

作者单位 药用资源与天然药物化学教育部重点实验室  西北濒危药材资源开发国家工程实验室  陕西师范大学生命科学学院 

母体文献 基因组学与应用生物学 

年卷期 2014(2)

页码 357-364

年份 2014 

关键词 丹参  海藻糖  基因克隆  表达分析 

文摘内容 对丹参EST序列进行Blast分析,得到一条海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)基因,将其命名为SmTPS,GenBank注册号为JF937196。该基因cDNA全长2 836 bp,包含一个长为2 574 bp的ORF,编码857个氨基酸。生物信息学分析表明,分子量为97.04 kD,等电点为5.76,含α-螺旋、β转角、延伸连和无规则卷曲。该蛋白同时具有海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)和海藻糖-6-磷酸磷酸酯酶(TPP)的功能结构域。系统进化树分析表明丹参TPS功能域和拟南芥AtTPS6属于一类,而TPP功能域与低等生物酵母ScTPS2属于一类。