鱼类环境DNA研究中通用引物的筛选验证

编号 zgly0001003535

文献类型 期刊论文

文献题名 鱼类环境DNA研究中通用引物的筛选验证

作者 刘军  赵良杰  凡迎春  张新磊  刘其根 

作者单位 上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室 

母体文献 淡水渔业 

年卷期 2016(1)

页码 9-17

年份 2016 

关键词 引物筛选  线粒体标记  环境DNA  千岛湖 

文摘内容 为了筛选一个通用性和适用性良好的能够运用于环境DNA(eDNA)研究的鱼类引物,从相关文献中选取了鱼类线粒体基因组部分片段的5对引物,分别对线粒体D-loop区、16S rRNA基因、COI基因以及Cytb基因部分片段进行扩增。对千岛湖48种鱼类基因组DNA进行扩增后比较发现,引物16s和COI均可以取得良好的扩增效果,通用性优于其他几对引物。引物16s的扩增产物经凝胶电泳检测均出现明亮的目的条带,引物COI则有3种鱼的条带经凝胶电泳检测亮度较暗。利用上述引物对环境样品eDNA扩增时发现,只有16s和COI的引物具有良好的扩增效果,能够得到明显单一的亮带。