山葡萄种质资源DNA条形码通用序列的筛选

编号 zgly0001567921

文献类型 期刊论文

文献题名 山葡萄种质资源DNA条形码通用序列的筛选

作者 宋慧芳  刘海双  杨义明  范书田  李昌禹  艾军 

作者单位 中国农业科学院特产研究所 

母体文献 植物学报 

年卷期 2017年06期

年份 2017 

分类号 S663.1 

关键词 山葡萄  DNA条形码  鉴定  ITS2  psbA-trnH  序列 

文摘内容 对山葡萄(Vitis amurensis)种质资源样品的ITS、ITS2、psb A-trn H、rbc L和mat K序列进行PCR扩增及测序,优化PCR反应的退火温度,比较各序列的扩增效率、测序成功率、品种间和品种内的差异及barcoding gap图,使用BLAST和NJ树法比较不同序列的鉴定能力,最终从5条DNA片段中筛选出可用于山葡萄种质资源鉴定的DNA条形码通用序列。结果表明,在采集的11份33个山葡萄样品中,psb A-trn H和ITS2序列的扩增与测序成功率较高,其品种间、品种内差异及barcoding gap较ITS、rbc L和mat K序列具有明显的优势,且ITS2序列能够鉴别psb A-trn H序列无法鉴别的品种。实验证明,ITS2和psb A-trn H序列是较适合鉴别山葡萄资源的DNA条形码序列组合。DNA条形码弥补了形态学鉴定的不足,可为山葡萄种质资源的准确鉴定提供科学依据。