基于mtCOI基因序列的中国葱斑潜蝇不同地理种群遗传多样性分析

编号 zgly0001714824

文献类型 期刊论文

文献题名 基于mtCOI基因序列的中国葱斑潜蝇不同地理种群遗传多样性分析

作者 钟裕俊  杜素洁  潘立婷  王玉生  王福莲  刘万学 

作者单位 长江大学农学院长江大学昆虫研究所  中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2020年06期

年份 2020 

分类号 S433 

关键词 葱斑潜蝇  线粒体COI基因  地理种群  遗传多样性  系统进化分析 

文摘内容 【目的】葱斑潜蝇Liriomyza chinensis是葱蒜类蔬菜上的重要经济害虫,在我国广泛分布。本研究旨在阐析中国葱斑潜蝇的地理种群遗传分化。【方法】以中国8省12个不同地理种群的253头葱斑潜蝇为样本,测定其mtCOI基因序列;依据获得的mtCOI基因序列,利用MEGA7.0, DnaSP 6.1和Arlequin 3.5等软件对葱斑潜蝇地理种群的遗传多样性、基因流水平和遗传变异等进行分析。【结果】在253头个体的759 bp mtCOI基因片段中,获得13个单倍型,各单倍型间K2P遗传距离均小于0.02;其中单倍型Hap1为12个地理种群所共享,总发生频率高达81.82%。总群体单倍型多样性较低（Hd=0.327）,核苷酸多样性（Pi）为0.00159,核苷酸平均差异数（K）为1.21011;葱斑潜蝇总群体遗传分化程度中等(FST=0.06971),基因交流较充分（Nm=3.33629）。分子方差分析（AMOVA）结果表明,遗传变异来源为群体内;总群体Tajima’s D检验值为显著负值;Mantel检测结果说明种群间的遗传距离与地理距离没有相关性。【结论】中国葱斑潜蝇地理种群的遗传多样性较低,基因交流较充分,遗传分化程度中等,且地理距离并不影响其遗传分化程度;葱斑潜蝇总群体在较近的历史时期未经历明显的种群扩张和种群增长。