蕨类植物rpoC1内含子缺失及其分子进化速率

编号 zgly0001715605

文献类型 期刊论文

文献题名 蕨类植物rpoC1内含子缺失及其分子进化速率

作者 彭阳  苏应娟  王艇 

作者单位 华南农业大学生命科学学院  中山大学生命科学学院  中山大学深圳研究院 

母体文献 植物学报 

年卷期 2020年03期

年份 2020 

分类号 Q943.2 

关键词 rpoC1  内含子  正选择位点  选择压力 

文摘内容 rpoC1基因编码RNA聚合酶β￠亚基蛋白,在转录过程中与DNA模板结合,与β亚基形成的β-β￠亚基复合体构成RNA合成的催化中心。以rpoC1基因为研究对象,在贝叶斯因子大于20的条件下,用HyPhy软件位点模型检测到3个正选择位点和541个负选择位点;用PAML软件位点模型检测到10个正选择位点,其中3个位点的后验概率超过99%。此外,基于最大似然法构建64种蕨类植物的系统发育树,结合HyPhy软件分析rpoC1基因的转换率、颠换率、转换率/颠换率、同义替换率、非同义替换率以及同义替换率/非同义替换率,探讨rpoC1基因内含子丢失与分子进化速率的关系。结果表明, rpoC1基因内含子缺失对转换率、颠换率以及非同义替换率有一定影响。