植物盐超敏感基因(SOS1)的演化分析与选择压力检测

编号 zgly0001528934

文献类型 期刊论文

文献题名 植物盐超敏感基因(SOS1)的演化分析与选择压力检测

作者 杨平  周峰  张边江  王立科  钱保俐  陈全战 

作者单位 南京晓庄学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年08期

年份 2016 

分类号 Q943.2 

关键词 SOS1基因  选择压力  适应性演化  净化选择 

文摘内容 以植物盐超敏感基因(Salt Overly Sensitive 1,SOS1)为研究对象,通过探讨SOS1基因在演化过程中所受到的选择压力,为植物逆境生长适应性的研究提供依据。通过生物信息学分析方法,从NCBI等网站获取完整的植物SOS1基因编码区核酸序列和蛋白质氨基酸序列,并利用MEGA和Mrbayes软件构建演化关系树;用PAML等软件剖析了61条SOS1基因序列受到生物选择压力,并计算了相关系数。系统进化树揭示了植物SOS1基因能被划分为3个分支,分别为SOS1单子叶植物分支,SOS1双子叶植物类群分支,SOS1苔藓植物分支。利用PAML软件对植物SOS1基因序列位点进行正选择位点分析,发现:(1)M8模型检测出39个正选择位点,22个位点达到显著水平,其中17个达到极显著水平;(2)净化选择对SOS1基因起主导作用。