360度群体遗传变异扫描——大豆泛基因组研究

编号 zgly0001715620

文献类型 期刊论文

文献题名 360度群体遗传变异扫描——大豆泛基因组研究

作者 祝光涛  黄三文 

作者单位 云南师范大学马铃薯科学研究院  中国农业科学院农业基因组研究所岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心 

母体文献 植物学报 

年卷期 2020年04期

年份 2020 

分类号 S565.1 

关键词 大豆  泛基因组  图基因组  遗传变异  农艺性状 

文摘内容 大豆(Glycinemax)是重要的油料和蛋白作物,其丰富的遗传变异为生物学性状挖掘和育种改良提供了重要的资源基础。然而,单个基因组信息无法全面揭示种质资源的遗传变异,泛基因组研究为解决这一不足提供了新方案。近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜和梁承志研究团队从2 898份大豆种质中选取26份代表性材料,并整合已有的3个基因组,构建了包含野生和栽培大豆的泛基因组和图基因组(graph-basedgenome),鉴定了整个群体的绝大多数结构变异数据集,确定了大豆种质的核心、非必需和个体特异的基因集。利用这些数据系统地揭示了生育期位点E3的等位基因变异和基因融合事件、种皮颜色基因I的单体型和演化关系以及结构变异对铁离子转运基因表达和地区适应性选择的影响。该研究为作物基因组学研究提供了一个新的模式,同时将加速推动大豆遗传变异的鉴定、性状解析和种质创新。