川桑丝氨酸蛋白酶抑制剂基因的鉴定与表达模式分析

编号 zgly0001468583

文献类型 期刊论文

文献题名 川桑丝氨酸蛋白酶抑制剂基因的鉴定与表达模式分析

作者 王裕鹏  梁九波  丁光宇  李文生  杨光伟  何宁佳 

作者单位 家蚕基因组生物学国家重点实验室  西南大学蚕学与系统生物学研究所 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2014年04期

年份 2014 

分类号 S888.2 

关键词 川桑  丝氨酸蛋白酶抑制剂  基因家族  表达模式 

文摘内容 丝氨酸蛋白酶抑制剂(SPI)主要参与蛋白酶活性的调节,植物SPI具有抵御病原菌侵染和昆虫取食危害的功能。通过比对MEROPS数据库以及保守氨基酸基序的分析,在川桑(Morus notabilis)基因组中鉴定到34个SPI蛋白。这些SPI蛋白可分为Kunitz、Serpin和PI-Ⅰ3个家族,依据氨基酸序列中的半胱氨酸残基数目又将Kunitz家族成员分为4类。氨基酸多序列比对表明Serpin和PI-Ⅰ家族成员在序列上相对保守。基于川桑根、皮、花、芽、叶的RNAseq数据量化的RPKM值分析发现不同类型SPI基因的组织表达模式存在差异,暗示川桑不同类型SPI行使不同的生物学功能。以广东桑(Morus atropurpurea)品种粤桑-69851的幼叶作为创伤处理材料,检测PI-Ⅰ家族的6个SPI基因对创伤诱导响应的表达模式,其中有4个基因不同程度地受到创伤诱导而上调表达,推测它们在桑树防御昆虫咬食危害中具有重要作用。