RAD-seq技术及其在昆虫学研究中的应用

编号 zgly0001515598

文献类型 期刊论文

文献题名 RAD-seq技术及其在昆虫学研究中的应用

作者 魏书军  李冰艳  曹利军  朱家颖 

作者单位 北京市农林科学院植物保护环境保护研究所  西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2016年07期

年份 2016 

分类号 Q963 

关键词 RAD-seq  昆虫学  种群遗传学  物种界定  系统发育  遗传连锁图谱 

文摘内容 限制性酶切位点关联DNA测序技术(restriction-site-associated DNA sequencing,RAD-seq)是在二代测序技术基础上发展起来的一种简化基因组技术(reduced-representation genome sequencing,RRGS)。RAD-seq利用限性核酸内切酶使基因组片段化,经过修饰后连接含标记的接头构建文库并进行测序。因其具有操作简单、实验成本低、通量高等优点,在分子生态学、进化基因组学、保护遗传学等领域得到应用。目前发展起来的RAD-seq技术主要包括利用稀有酶和物理打断方式进行基因组片段化的mbRAD、利用稀有酶和常见酶组合酶切的方式进行基因组片段化的ddRAD、利用IIB型限制性内切酶得到短片段文库的2bRAD、利用同裂酶和Illumina试剂盒建库的ezRAD和完全利用Nextera试剂盒建库的nextRAD。本文对每种RAD-seq技术的特点及其在昆虫种群遗传学、群落生态学、物种界定、系统发育和遗传连锁图谱构建等研究领域的应用进行了综述。