水曲柳FmGT8家族基因生物信息及表达模式分析

编号 zgly0001527890

文献类型 期刊论文

文献题名 水曲柳FmGT8家族基因生物信息及表达模式分析

作者 周姗  詹亚光  董恒  刘婧婧  曾凡锁 

作者单位 东北林业大学生命科学学院 

母体文献 南京林业大学学报(自然科学版 

年卷期 2016年02期

年份 2016 

分类号 S792.41 

关键词 水曲柳  FmGT8  时空表达  应拉木  生物信息学 

文摘内容 为研究水曲柳糖基转移酶8家族(glycosyltransferases,FmGT8)基因结构特征及编码蛋白性质,揭示其时空表达模式以及对应拉处理的响应机制,在获得4个水曲柳FmGT8基因的基础上,应用生物信息学软件对Fm GT8及其编码蛋白进行详细的分析;选择5—9月的水曲柳叶子、木质部以及外皮样本,利用实时荧光定量PCR分析FmGT8基因的表达模式;对水曲柳分别进行1、3、7 d的应拉处理,分析Fm GT8基因转录表达对应拉处理的响应模式。结果显示:获得了3个FmGT8全长基因(FmGT8-1,FmGT8-2,FmGT8-3)和1个Fm GT8基因片段(Fm GT8-4),已上传至NCBI并获得登录号分别为KP307672、KP307673、KP307674、KP307675。FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-3在木质部中表达量最高,Fm GT8-4在外皮中的表达量最高;FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-3均在6月的相对表达量达到最高,Fm GT8-4在9月表达量最高。4个基因在应拉处理材料中的表达模式各不相同,但均对应拉处理有响应。FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-4在应拉受力面的表达量最高,FmGT8-3在应压受力面表达量最高,说明FmGT8具有时空特异性。研究结果表明FmGT8家族基因可能参与了细胞壁与木质素的合成。