毛竹萜类合成酶基因家族序列鉴定与表达分析

编号 zgly0001645312

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹萜类合成酶基因家族序列鉴定与表达分析

作者 秦政  郑永杰  张文根  张龙  黎祖尧  杨光耀 

作者单位 江西农业大学江西省竹子种质资源与利用重点实验室  江西省林业科学院  江西特色林木资源培育与利用2011协同创新中心 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S795.7 

关键词 毛竹  萜类合成酶  进化分析  表达模式 

文摘内容 通过生物信息学方法,对毛竹(Phyllostachys edulis(Carrière)J.Houzeau)TPS基因家族的成员进行鉴定,并对其编码蛋白的理化性质、基因结构、进化关系、蛋白结构、启动子元件及表达模式进行了分析。结果表明,毛竹全基因组含有14个TPS候选基因,大小为693~2439 bp。编码蛋白等电点为5.08~8.17。系统发育分析结果显示,毛竹含有TPS-a、TPS-b、TPS-e/f、和TPS-g 4个亚家族,成员数目分别为6、5、2、1个。TPS蛋白质二级结构中,α-螺旋和无规则卷曲所占比重较大;毛竹TPS基因家族各成员蛋白三维结构比较相似。基因启动子分析共获得50个调控元件,可分为6大类,其中光响应相关元件数量最多,共包含17个顺式调控元件。基于转录组测序数据构建的基因表达谱热图分析结果表明,Pe TPS在叶、花和笋等7个组织中的表达差异明显,表现出组织特异性,其中Pe TPS9仅在早花期花序中表达,Pe TPS8仅在叶中表达。