蒺藜苜蓿耐酸铝性状的全基因组关联分析

编号 zgly0001625045

文献类型 期刊论文

文献题名 蒺藜苜蓿耐酸铝性状的全基因组关联分析

作者 姜格格  宋丽莉  郭东林  蔡洪生  郭长虹  束永俊 

作者单位 黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院 

母体文献 草业学报 

年卷期 2013年04期

年份 2013 

分类号 S541.9 

关键词 蒺藜苜蓿  全基因组关联分析  EMMA  基因组选择  岭回归 

文摘内容 铝毒害是酸性土壤耕种的主要限制因素,每年造成大量作物减产。蒺藜苜蓿是紫花苜蓿的一年生近缘种,广泛分布于世界各地,是紫花苜蓿遗传改良的重要基因资源。本研究利用蒺藜苜蓿群体的耐酸铝性状差异,进行全基因组关联分析,筛选蒺藜苜蓿耐酸铝性状相关的遗传位点,共得到58个与蒺藜苜蓿耐酸铝性状相关的SNP标记。对其周围基因进行功能注释分析,发现这些SNP位点主要参与苜蓿的细胞壁、脂质代谢、环境胁迫响应过程、氧化还原反应过程以及小分子转运等过程。最后,通过基因组选择方法将发掘SNP标记应用到蒺藜苜蓿耐酸铝性状的预测,预测准确性达到0.80,这说明本研究发掘的SNP标记可以用于蒺藜苜蓿及其近缘物种紫花苜蓿耐酸铝性状的遗传改良。