基于COⅠ基因的二化螟种群遗传多样性检测方法

编号 zgly0001478182

文献类型 期刊论文

文献题名 基于COⅠ基因的二化螟种群遗传多样性检测方法

作者 李晴  梁玉勇  厉建蕾  程正新  熊焕保  刘雨芳  桂芳艳  马伟 

作者单位 上海交通大学生命科学技术学院  微生物代谢国家重点实验室  江西省农科院植物保护研究所  湖南科技大学生命科学学院 

母体文献 应用昆虫学报 

年卷期 2014年05期

年份 2014 

分类号 S435.112.1 

关键词 二化螟  转基因水稻  COⅠ  遗传多样性  DGGE 

文摘内容 【目的】建立二化螟Chilo suppressalis(Walker)遗传多样性检测与分析方法,以研究转基因水稻是否会对二化螟(靶标昆虫)种群遗传多样性产生显著影响。【方法】从江西、湖南两地采集的二化螟样本中,各随机挑选12只,提取基因组DNA,克隆COⅠ基因的35~692 bp区段(658 bp)进行测序;同时,采用PCR-DGGE技术分析江西3个样本的COⅠ基因遗传多样性,以获取样本群体遗传多样性信息。【结果】对158个COⅠ基因克隆测序结果分析发现,在658 bp的区段中,共有173个位点存在多态,江西二化螟种群的单倍型多样度(h)为0.820,而湖南二化螟种群的单倍型多样度(h)仅为0.542,江西二化螟COⅠ基因多态要比湖南样本丰富。对COⅠ基因1 278~1 493 bp区段(266 bp)进行DGGE分析,共获得5条清晰条带,将分析的3只二化螟样本分成两类,该结果与基因测序结果一致。【结论】测序方法可以获得丰富、详细的二化螟目标基因多态信息,但工作量、实验周期及成本较高;DGGE方法虽然信息量较小,但有通量大、实验周期短、成本低等优点,因此该方法适用于二化螟等昆虫大样本种群遗传多样性研究。本研究建立的方法可以为判断转基因水稻是否会对靶标、非靶标昆虫的遗传多样性产生影响提供可靠的分子依据。