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番茄细菌性斑点病菌实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用



编号 zgly0001659516

文献类型 期刊论文

文献题名 番茄细菌性斑点病菌实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

作者 柴阿丽  帕提古丽  郭威涛  石延霞  谢学文  席先梅  李宝聚 

作者单位 中国农业科学院蔬菜花卉研究所  新疆农业科学院园艺作物研究所  内蒙古农牧业科学院植物保护研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年01期

年份 2019 

分类号 S436.412 

关键词 番茄  丁香假单胞菌番茄致病变种  实时荧光定量PCR  种子检测  组织检测 

文摘内容 以番茄细菌性斑点病病原菌丁香假单胞菌番茄致病变种(Pseudomonas syringae pv. tomato,Pst)的致病相关基因HrpZ为靶序列,设计了特异性引物Pst3F/Pst3R,能从Pst基因组DNA中特异性扩增出大小为161 bp的目的片段。建立的Pst实时荧光定量PCR检测技术体系的检测灵敏度比普通PCR高1 000倍。利用实时荧光定量PCR检测体系,检测模拟带菌种子中Pst的带菌量,检测下限为4.21 cfu·g-1;检测人工接种叶片组织中Pst的带菌量,检测到1级发病叶片带菌量为4.15×102 cfu·g-1。对田间采集的63个番茄细菌性斑点病明显症状和疑似症状样本,分别进行了实时荧光定量PCR、普通PCR和病原菌分离检测,检测到54个样本中含有Pst,3种方法检测结果一致。结果表明,建立的Pst实时荧光定量PCR检测体系具有特异性强、灵敏度高的特点,可以快速准确地定量检测番茄种子和发病组织中Pst的含量,为番茄细菌性斑点病的早期预防和流行监测提供了有效的技术手段。

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