悬钩子皮下盘菌种内遗传多样性的ITS序列分析

编号 zgly0000710918

文献类型 期刊论文

文献题名 悬钩子皮下盘菌种内遗传多样性的ITS序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘芳  林英任  王士娟  高小明  陈莉  贾国军 

作者单位 安徽农业大学林学与园林学院  安徽农业大学生命科学学院 

母体文献 福建农林大学学报: 自然科学版 

年卷期 2011,40(1)

页码 54-57

年份 2011 

分类号 Q949.32 

关键词 皮下盘菌属  模式种  rDNA-ITS序列  遗传多样性  寄主 

文摘内容 通过组织分离法对采自安徽各地的悬钩子皮下盘菌(Hypoderma rubi)鲜材料进行分离培养,共获得12个纯菌株,对各菌株进行DNA提取、rDNA-ITS区PCR扩增和序列测定.序列比较分析表明,悬钩子皮下盘菌ITS序列长度为443-456bp,G+C含量为48.7%-51.5%;不同菌株间的ITS区序列变异较大,该菌种内遗传多样性丰富.同时利用MEGA 4.1软件中的邻接法(neighbour-joining method,NJ)构建系统发育树表明,寄主种类对悬钩子皮下盘菌种内遗传多样性会产生较大影响,木本植物和草本植物上的悬钩子皮下盘菌菌株可能是亲缘关系较远的2个类群;该菌种内遗传差异与其寄生部位和采集地无明显相关性.