百合肌动蛋白基因lilyActin的克隆与表达分析

编号 zgly0001456879

文献类型 期刊论文

文献题名 百合肌动蛋白基因lilyActin的克隆与表达分析

作者 梁云  袁素霞  冯慧颖  徐雷锋  袁迎迎  刘春  明军 

作者单位 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2013年07期

年份 2013 

分类号 S682.29 

关键词 百合  Actin基因  基因克隆  表达分析  内参基因 

文摘内容 为了在百合功能基因表达研究中选择一个理想内参基因,依据岷江百合cDNA文库所获得的百合肌动蛋白(Actin)基因的EST序列,采用RACE技术进行该基因cDNA全长克隆,并利用实时荧光定量PCR分析其在不同组织中的表达模式,获得百合肌动蛋白基因cDNA全长序列(GenBank登录号:JX826390),命名为lilyActin。该基因cDNA全长1367bp,其中,5′非编码区91bp,3′非编码区233bp,开放读码框1134bp,编码377个氨基酸。序列比对发现,该基因与其它15种植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性均在80%以上,氨基酸序列的相似性达98%。进化分析显示,百合肌动蛋白与郁金香肌动蛋白的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR结果显示,该基因在百合的花蕾、叶片和鳞片组织中恒定表达,表明相对于其他物种的内参基因,lilyActin更适宜作为百合属植物的内参基因。