PCR产物直接测序还是克隆测序？—密叶杉属rDNA ITS序列的测定方法

编号 zgly0000281383

文献类型 期刊论文

文献题名 PCR产物直接测序还是克隆测序？—密叶杉属rDNA ITS序列的测定方法

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李春香  杨群 

作者单位 中国科学院南京地质古生物研究所 

母体文献 植物学通报 

年卷期 2002,19(6)

页码 698-704

年份 2002 

分类号 Q943 

关键词 PCR产物  直接测序  克隆测序  密叶杉属  rDNA  ITS序列  测定方法  协同进化 

文摘内容 通过PCR产物直接测序和克隆测序对三种密叶杉属(Athrotaxis)植物rDNA内转录间隔区(ITS)及5.8SrDNA序列进行了测定与分析。实验表明A.selaginoides rDNA重复序列间的纯合程度很多, 对PCR产物直接测序就可以测定其ITS区序列。而A.laxifolia、A.cupressoides的ITS1重复序列间的纯合程度较低, 各重复单位间序列存在插入/缺失, 只有对PCR产物进行克隆测序才能确定其序列。A.laxi-folia、A.cupressoides的ITS2区尽管也存在多态性, 但不同重复序列的浓度比较平均, 对PCR产物直接测序就可确定重复序列间的变异情况。本实验表明尽管是同一属的三种植物, 但其rDNA重复序列间的纯合程度不同, 同一植物ITS的不同区域, 其重复序列间的纯合程度也不同, 针对不同的ITS片段可采用不同的方法以测定其序列。