PCR产物直接测序还是克隆测序?——密叶杉属rDNAITS序列的测定方法

编号 zgly0001257514

文献类型 期刊论文

文献题名 PCR产物直接测序还是克隆测序?——密叶杉属rDNAITS序列的测定方法

作者 李春  香杨群 

作者单位 中国科学院南京地质古生物研究所  中国科学院南京地质古生物研究所 南京210008  南京210008 

母体文献 植物学通报 

年卷期 2002年06期

年份 2002 

分类号 Q943 

关键词 密叶杉属  ITS  协同进化  PCR产物直接测序  PCR产物克隆测序 

文摘内容 通过PCR产物直接测序和克隆测序对三种密叶杉属 (Athrotaxis)植物rDNA内转录间隔区 (ITS)及5 .8SrDNA序列进行了测定与分析。实验表明A .selaginoidesrDNA重复序列间的纯合程度很高 ,对PCR产物直接测序就可以测定其ITS区序列。而A .laxifolia、A .cupressoides的ITS1重复序列间的纯合程度较低 ,各重复单位间序列存在插入 /缺失 ,只有对PCR产物进行克隆测序才能确定其序列。A .laxi folia、A .cupressoides的ITS2区尽管也存在多态性 ,但不同重复序列的浓度比较平均 ,对PCR产物直接测序就可确定重复序列间的变异情况。本实验表明尽管是同一属的三种植物 ,但其rDNA重复序列间的纯合程度不同 ,同一植物ITS的不同区域 ,其重复序列间的纯合程度也不同 ,针对不同的ITS片段可采用不同的方法以测定其序列。