高油酸油菜成熟期种子转录组分析

编号 zgly0001634596

文献类型 期刊论文

文献题名 高油酸油菜成熟期种子转录组分析

作者 张振乾  常涛  王晓丹  王峰  王国槐  邬贤梦  胡琼  官春云 

作者单位 湖南农业大学农学院南方粮油作物协同创新中心  农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年06期

年份 2018 

分类号 S565.4 

关键词 高油酸油菜  转录组  定量PCR 

文摘内容 为了找出差异基因用于高油酸油菜育种,对两个油酸含量不同的高油酸油菜材料(油酸含量分别为84.4%和56.2%)成熟期种子进行转录组分析和实时荧光定量PCR分析。Illumina Hiseq TM2000测序得到8.09 Gb clean reads,组成52 361个unigene,平均长度为659 bp。比对公共数据库得到48 911(93.41%)个氨基酸序列。鉴定出6 414个在高油酸油菜和低油酸油菜中差异显著的基因,这些基因有1 296个在高油酸油菜中上调表达(20.21%),5 118个下调表达(79.79%),共有2 043个差异基因在119个代谢通路中富集表达。将其中14个与脂肪酸代谢和光合作用相关基因进行荧光定量PCR验证。Bna0799930,Bna0104450和Bna0305890在高油酸油菜中上调表达,其余的下调表达。Bna0501620,Bna0391450和Bna0084310在高油酸油菜中的表达量超过低油酸油菜中表达量2倍以上,分别为4.48倍,4.21倍和2.26倍。这些新发现的差异基因可用于高油酸油菜分子育种研究。