基于转录组数据对陆地棉GhHMP1的克隆及表达分析

编号 zgly0001644979

文献类型 期刊论文

文献题名 基于转录组数据对陆地棉GhHMP1的克隆及表达分析

作者 韩明格  王晓歌  杨笑敏  王德龙  王俊娟  王帅  郭丽雪  樊伟丽  陈超  叶武威 

作者单位 新疆农业大学农学院  中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年17期

年份 2018 

分类号 S562 

关键词 棉花  镉胁迫  GhHMP1  基因克隆  表达分析 

文摘内容 本研究就转录组数据分析得到一个与镉胁迫相关的基因GhHMP1(Heavy metal transport/detoxification superfamily protein1),并从陆地棉耐镉品种‘邯242’中克隆成功。为研究该基因的功能和特点,对其进行生物信息学分析、转录组分析和实时荧光定量表达分析。结果表明:陆地棉‘邯242’基因GhHMP1的CDS全长为402 bp,编码133个氨基酸,分子量约为14.88 kD,等电点为8.20;转录组和实时荧光定量分析表明,GhHMP1基因的表达具有组织特异性,且受镉胁迫诱导,可以作为重要的候选基因来培育棉花耐镉新材料,从而为棉花耐镉育种及修复重金属污染土壤提供重要的理论依据。