藏鸡NDV的分离鉴定及F基因的遗传进化分析

编号 zgly0000807327

文献类型 期刊论文

文献题名 藏鸡NDV的分离鉴定及F基因的遗传进化分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 朱洪云  旦巴次仁 

作者单位 西藏农牧学院 

母体文献 西北农林科技大学学报: 自然科学版 

年卷期 2012(10)

页码 31-37

年份 2012 

分类号 S852 

关键词 藏鸡  新城疫病毒  F基因 

文摘内容 【目的】:探讨藏鸡NDV的毒力和F基因的遗传进化特征。【方法】:从采集的藏鸡病料中分离鉴定NDV, 通过测定鸡胚平均致死时间(MDT)和1日龄雏鸡脑内接种致死指数(ICPI)来确定分离株的毒力。采用RTPCR方法克隆藏鸡NDV分离株F基因, 测序后进行序列分析, 并进行进化分析。【结果】:共分离鉴定出F5、FX10、F20、F74、F75、F17、F72、FH2等8株NDV, 其中F17、F72、FH2为强毒株, 其余5株为弱毒株。8株病毒F基因ORF均为1 662 bp, 编码553个氨基酸, 强毒株ORF编码产物含有12个半胱氨酸残基, 弱毒株有13个半胱氨酸残基, 比强毒株在27位(强毒株C^27变为R^27)多了1个半胱氨酸残基; 有6个潜在的糖基化位点。分离的8株NDV与GenBank中发表的20株NDV参考毒株比较结果表明, F蛋白氨基酸序列变异位点较多, 主要集中在8-30, 97-124, 45, 385-386, 402-403, 479-494, 509-520位氨基酸处, 强毒株AA替代较集中, 而弱毒株保守区较多且AA替代较分散。分离NDV株之间F基因编码区核苷酸序列同源性为83.5%～99.9%, 其中强毒株之间同源性为95.2%～99.4%, 弱毒株之间同源性为99.4%～99.9%。分离NDV株之间F基因编码的氨基酸同源性为87.5%～99.5%, 其中强毒株之间同源性为95.3%～98.2%, 弱毒株之间同源性为98.6%～99.5%。进化分析显示, 3株强毒株均为基因Ⅶ型, 5株弱毒株均为基因Ⅱ型。【结论】:分离了8株藏鸡NDV, 其中3株为强毒株, 属于基因Ⅶ型; 5株为弱毒株, 属于基因Ⅱ型。