广东省地方鸡线粒体遗传多样性与母系起源

编号 zgly0001635037

文献类型 期刊论文

文献题名 广东省地方鸡线粒体遗传多样性与母系起源

作者 黄勋和  余哲琪  翁茁先  何丹林  易振华  李威娜  陈洁波  张细权  杜炳旺  钟福生 

作者单位 嘉应学院生命科学学院  广东省五华三黄鸡科技创新中心  湖南农业大学动物科学技术学院  华南农业大学动物科学学院  广东海洋大学农学院 

母体文献 生物多样性 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 S831 

关键词 广东地方鸡  线粒体DNA  D-loop  遗传多样性  起源 

文摘内容 系统评估地方鸡的遗传变异水平并追溯其母系起源,可为保护利用优质家禽种质资源库提供科学依据。本研究测定了广东省和邻省共12个地方鸡品种的线粒体DNA D-loop序列,分析品种间的遗传距离与系统关系,并构建单倍型系统发生树和中介网络图。360份样品共检测到60个突变位点,均为转换。定义了85种单倍型,归属于单倍型类群A、B、C和E,在12个鸡品种中均有分布,其中B是优势单倍型类群(187个,51.94%),E次之(76个,21.11%)。B02和C01是优势单倍型(85个,23.61%;48个,13.33%),为12个鸡品种共有;E03位居第三(35个,9.72%),杏花鸡、黄郎鸡和宁都三黄鸡未见此单倍型。杏花鸡集中分布在单倍型类群B,惠阳胡须鸡和中山沙栏鸡则主要分布在单倍型类群E;怀乡鸡的单倍型数量最多,中山沙栏鸡的最少。广东地方鸡品种间遗传距离为0.012–0.015,单倍型多样性0.805±0.047至0.949±0.026,核苷酸多样性0.0102±0.0017至0.0138±0.0009。邻接树和中介网络图将85种单倍型划分为进化枝A、B、C和E,广东省与邻省地方鸡单倍型的地理分布模式相似。中性检验显示广东地方鸡未经历明显的群体历史扩张。结果表明广东地方鸡处于较好的保护状态,遗传多样性水平较高,品种的形成受到邻省和北方家鸡的影响,东南亚红原鸡对广东地方鸡也有重要的遗传贡献。