松材线虫HAP基因家族鉴定及生物信息学分析

编号 zgly0001743036

文献类型 期刊论文

文献题名 松材线虫HAP基因家族鉴定及生物信息学分析

作者 曹景鑫  郝昕  李洋  李璐  张月  梁立巍  杨显良  马玲 

作者单位 东北林业大学林学院  东北林业大学  赤塔农业科技研究所 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2022,50(9)

页码 120-127

年份 2022 

分类号 Q754 

关键词 松材线虫  HAP基因家族  基因组鉴定  基因表达 

文摘内容 为了解松材线虫体内分泌的组氨酸酸性磷酸酶(HAP)在侵染寄主过程中的作用,从生物信息学角度,通过松材线虫全基因组数据,鉴定松材线虫HAP基因家族成员,对其进行理化性质、信号肽、跨膜结构域、系统发育、染色体定位、基因结构及保守基序分析。并且通过松材线虫接种黑松不同时期和被松树代谢产物β-蒎烯胁迫后的转录组数据,对松材线虫HAP基因家族成员进行基因表达谱分析,进而对不同松树代谢产物处理下松材线虫体内BxHAP基因表达定量分析。结果表明:鉴定出的34个松材线虫HAP基因家族成员多数为酸性蛋白,12个成员为典型效应因子;34个成员分属于6个不同的亚家族,均匀分布在松材线虫前6条染色体上,基因结构和保守基序在各亚家族内部保持相对一致;BxHAP基因在松材线虫侵染松树过程中发挥重要功能,具有影响松树代谢产物的能力,其中BxHAP5在松材线虫抵抗松树代谢产物过程中发挥重要作用。因此,通过对松材线虫HAP基因家族鉴定和表达分析,为深入解析松材线虫与寄主间复杂的相互关系提供了新思路,为探索松材线虫病发生机制提供新方向。