云南栽培稻种SSR遗传多样性比较

编号 zgly0001372666

文献类型 期刊论文

文献题名 云南栽培稻种SSR遗传多样性比较

作者 吕广磊  蔺忠龙  白现广  Kyung-Ho Ma  付坚  刘芳芳  黄兴奇  Jae-Gyun Gway  程在全 

作者单位 云南农业大学农学与生物技术学院  云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所  云南大学生命科学学院  韩国农业生物技术遗传资源所 

母体文献 植物学报 

年卷期 2009年04期

年份 2009 

分类号 S511 

关键词 栽培稻  遗传多样性  选育品种  地方品种  SSR 

文摘内容 采用64个SSR标记对96份云南水稻(Oryza sativa)地方品种和选育品种的遗传多样性进行比较分析。结果发现64个标记都具有多态性,共检测到741个等位基因,每个多态性位点检测到的等位基因数为2-29个,平均11.57个;Nei基因多样性指数(He)范围在0.345(RM321)-0.932(RM1)之间,平均为0.56。水稻品种的遗传多样性并非按地理位置均匀分布,而是在相似系数为0.17的水平上明显分为2个不同类群,即籼稻类群和粳稻类群,且籼粳亚种间的SSR多样性差异不明显,籼稻平均等位基因数(Ap)和Nei基因多样性指数(Ap=10.6,He=0.46)与粳稻品种(Ap=10.7,He=0.48)十分接近,可能与这些品种间存在一定频率的基因交流有关。糯稻和非糯稻在籼稻群和粳稻群中都有表现,没有特别的分布规律。云南栽培稻选育品种与地方稻亲缘关系较近,其遗传基础可能来源于云南水稻地方品种。本研究结果表明,SSR标记能较好地区分云南栽培稻品种,且云南水稻地方品种遗传多样性丰富,存在大量的优质性状可供育种实践选择。