实时荧光定量PCR检测核桃胶胞炭疽菌

编号 zgly0001648976

文献类型 期刊论文

文献题名 实时荧光定量PCR检测核桃胶胞炭疽菌

作者 余鹏举  朱天辉  万雪琴  李姝江  王若梅  韩珊 

作者单位 四川农业大学 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2018年11期

年份 2018 

分类号 S436.64 

关键词 核桃  胶胞炭疽菌  SYBRGreenI实时荧光定量PCR  分子检测 

文摘内容 为快速灵敏检测核桃炭疽病病原菌,根据Gen Bank中炭疽属(Colletotrichum)不同种的ITS序列差异,设计了核桃炭疽病病原菌胶胞炭疽菌(C. gloeosporioides)的特异性引物YH1/YH2,并优化建立了检测核桃胶胞炭疽菌的SYBR Green I实时荧光定量PCR检测体系。结果表明:该引物能从实验室分离保存鉴定的13株核桃胶胞炭疽菌中特异性扩增出306bp的目的条带,而对于其他6种核桃常见病害病原菌、健康核桃植株组织及所有微生物总基因组DNA均未扩增出特异性条带;建立的实时荧光定量PCR检测体系灵敏度为1×10-3mg·L-1,是常规PCR检测方法的100倍;对10份采集于四川、陕西、湖北等地的林间感病核桃植株组织进行定量检测,实时荧光定量PCR的阳性检出率为80%,且样品病症表现越明显检测到的含菌量越高。建立的SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法可用于核桃感病组织内胶胞炭疽菌的分子鉴定和早期检测。