基于cpDNA rps16序列分析兰考泡桐与白花泡桐和毛泡桐的遗传关系

编号 zgly0001527749

文献类型 期刊论文

文献题名 基于cpDNA rps16序列分析兰考泡桐与白花泡桐和毛泡桐的遗传关系

作者 莫文娟  李少锋  邱乾栋  孙长忠  汤志敏  乔杰  杜红岩  傅建敏 

作者单位 中国林业科学研究院华北林业实验中心  中国林业科学研究院经济林研究开发中心  北京林业大学生物科学与技术学院 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2016年03期

年份 2016 

分类号 S792.43 

关键词 兰考泡桐  白花泡桐  毛泡桐  rps16 

文摘内容 【目的】通过测序法分析兰考泡桐与白花泡桐和毛泡桐在叶绿体rps16序列上的遗传差异,旨在分析三者之间在叶绿体基因上的变化特点和规律,探讨其种间的遗传关系。【方法】选取兰考泡桐、白花泡桐和毛泡桐各15个样本,对其提取的DNA用PCR扩增获得特异片段,并将其纯化与测序。利用软件Clustal X 2.0对所得序列进行排序;运行MEGA 4软件,进行多序列比对,分析其序列特征,并计算出K2P遗传距离。【结果】(1)对获得的rps16序列进行测定分析,得兰考泡桐序列长度分别为932 933 bp;白花泡桐序列长度为932 bp;毛泡桐序列长度分别为916918 bp。对所得rps16序列进行排序后的长度为938 bp,平均GC含量为34.31%。3个种所代表的个体之间共有10个变异位点,占整个序列长度的1.07%。其中有9个变异位点属于碱基插入或缺失类型,占变异位点总数的90%,占整个序列长度的0.96%。有1个变异位点属于碱基替换类型,占整个变异位点总数的10%,占整个序列长度的0.11%。(2)整个rps16片段的序列共有10个变异位点,其中兰考泡桐与白花泡桐在总的变异位点上,具有一致的碱基位点9个,占总变异的90%。而兰考泡桐与毛泡桐相比,没有相同的碱基。【结论】根据三种泡桐的rps16序列的序列特征和变异位点的分析,表明在叶绿体遗传方面,兰考泡桐具有与白花泡桐更多相似的遗传物质,其亲缘关系较近。综上所述,推测兰考泡桐与白花泡桐可能来自同一母系遗传。