白花泡桐二四倍体的蛋白质组差异分析

编号 zgly0001716043

文献类型 期刊论文

文献题名 白花泡桐二四倍体的蛋白质组差异分析

作者 孙华乐  翟晓巧  曹喜兵  邓敏捷  赵振利  范国强 

作者单位 河南农业大学泡桐研究所  河南省林业科学研究院 

母体文献 森林与环境学报 

年卷期 2020年06期

年份 2020 

分类号 S792.43 

关键词 同位素标记相对定量和绝对定量  四倍体  白花泡桐  蛋白质组学 

文摘内容 为研究二倍体白花泡桐在四倍体形成过程中蛋白质的变化,利用同位素标记相对定量和绝对定量(iTRAQ)以及液相串联质谱技术,分析了四倍体泡桐及其二倍体亲本叶片中的蛋白质表达变化,并通过与转录组的关联,筛选与四倍体形成相关的蛋白质。研究结果共鉴定到696个蛋白质,其中,有75个差异表达,对这些差异蛋白质进行基因本体论(GO)功能分析,其主要富集在液泡、胞浆和非生物刺激响应等40个基因本论条目中。对这些差异蛋白质进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析表明,其主要参与35个代谢通路,包括光合作用、植物病原相互作用和次生代谢产物的生物合成等。通过蛋白质组和转录组关联分析,筛选到9个与倍性相关的差异蛋白质,基中4个注释到KEGG代谢通路,分别是镁螯合酶H亚基、V型H+转运ATPase亚基A、果糖二磷酸醛缩酶和细胞色素C氧化酶亚基5b。