古尔班通古特沙漠地衣结皮中可培养细菌多样性初探

编号 zgly0001603591

文献类型 期刊论文

文献题名 古尔班通古特沙漠地衣结皮中可培养细菌多样性初探

作者 吴楠  张元明  潘惠霞  邱东 

作者单位 中国科学院新疆生态与地理研究所干旱区生物地理与生物资源重点实验室  新疆农业大学草业与环境科学学院 

母体文献 中国沙漠 

年卷期 2013年03期

年份 2013 

分类号 Q938 

关键词 原核生物  RDP在线归类  EzTaxon-e数据库  Shannon-Wiener多样性指数  链霉菌属 

文摘内容 为了解古尔班通古特沙漠优势结皮类型——地衣结皮中可培养细菌的多样性,利用3种培养基经稀释涂布和划线分离得到18株纯培养菌株。对分离的所有菌株提取基因组DNA,利用细菌通用引物扩增得到16SrDNA的序列并测序。结果表明:(1)基于Ribosomal Database Project(RDP)在线归类分析,18株菌可初步归为3门3纲3目6科6属,未见新属,未分离到固氮菌属(Azotobacter)。其中,6株归为变形菌门(Proteobacteria)、6株属于放线菌门(Actinobacteria)、6株属于厚壁菌门(Firmicutes);不动杆菌属(Acinetobacter)、链霉菌属(Streptomyces)、芽孢杆菌属(Bacillus)为优势属,分别占分离菌株数的33%、28%、22%。(2)在EzTaxon-e数据库中对各菌株序列进行进一步的BLAST同源性分析表明,18株菌可进一步归为14个OTUs(Operational Taxonomic Unit),未见疑似新种(同源性均>97%),其中链霉菌属OTU比例最高(35.71%),依次为不动杆菌属和芽孢杆菌属(二者均为21.43%)。(3)古尔班通古特沙漠地衣结皮中的可培养细菌Shannon-Wiener多样性指数为2.5532,均匀度指数为0.9675。(4)上述可培养细菌在生物土壤结皮中具有固沙、加速矿化、生防等多重生态潜能。