香蕉根系均一化全长cDNA文库的构建和鉴定

编号 zgly0001398133

文献类型 期刊论文

文献题名 香蕉根系均一化全长cDNA文库的构建和鉴定

作者 王卓  殷晓敏  王家保  徐碧玉  金志强 

作者单位 中国热带农业科学院海口实验站  海南大学  中国热带农业科学院环境与植物保护研究所  中国热带农业科学院热带生物技术研究所  农业部热带生物技术重点开放实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2011年09期

年份 2011 

分类号 S668.1 

关键词 香蕉  根系  均一化  cDNA文库  基因  表达 

文摘内容 以香蕉幼苗根系为材料,利用DSN(duplex-specific nuclease)均一化技术与SMART(switching mechanismat5′end of RNA transcript)技术相结合,构建香蕉根系均一化全长cDNA文库。经检测,初级文库滴度1.1×106cfu·mL-1,库容5×106个独立克隆,重组率大于95%,插入片段平均长度大于1kb,表明文库质量较好。随机挑取192个克隆进行EST(expressed sequencetags)测序,成功获得179个高质量EST,含5个conting和174个singlet,冗余度仅为2.35%。小规模测序拼接后获得145个unigenes,对unigenes分析结果表明文库的可靠性好。从序列比对结果中挑选3个与其它植物同源的抗逆基因,利用RT-PCR方法进行了干旱、低温及盐胁迫条件下基因表达分析,结果显示这3个基因在不同的逆境下差异表达。