苜蓿假盘菌ISSR反应体系优化及指纹图谱构建

编号 zgly0000560842

文献类型 期刊论文

文献题名 苜蓿假盘菌ISSR反应体系优化及指纹图谱构建

作者 袁庆华  张君艳 

作者单位 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 

母体文献 草地学报 

年卷期 2008,16(1)

页码 17-22

年份 2008 

分类号 S812  Q943 

关键词 苜蓿假盘菌  ISSR  指纹图谱  亲缘关系 

文摘内容 以北京苜蓿假盘菌(Pseudopeziza medicaginis(Lib.)Sacc)菌株为试材，用ISSR-23引物[序列为(AC)s明研究PCR反应体系的主要成分及退火温度对假盘菌ISSR扩增的影响，以期为苜蓿假盘菌的深入研究奠定基础。结果表明：Primer、Mg^2＋、Taq酶和dNTP浓度对扩增均有影响，以Primer影响最为明显；优化的反应体系为：20μL反应体系中含0．1ng模板DNA，2．0mmol／L MgCl2、0．5／μmol／L Primer、IU Taq DNA聚合酶、0．2mmol／L dNTP，2μL ×10×PCR Buffer和2．5％去离子甲酰胺；在此基础上，建立6个不同地理来源苜蓿假盘菌菌株的指纹图谱并分析其亲缘关系；对44条ISSR引物进行筛选，22条可产生清晰稳定的多态性条带，其中16条可将6个供试菌株完全分开，建立了苜蓿假盘菌指纹图谱；经聚类分析，在0．55遗传相似水平下，6个供试菌株分为两个遗传谱系，菌株的遗传谱系与其地理来源之间不表现相关性。